Il existe 2 écoles qui permettent d'appréhender le combat rapproché. Chaque école compte comme un domaine Ninja et vous pourrez devenir expert dans l'une ou plusieurs de ces écoles. Pour devenir un combattant polyvalent et complet au combat rapproché, il vous faudra sacrifier 4 domaines en tout afin de connaitre toutes les techniques de combat (Shunshin / Jujitsu / Taekwendo / Génie du combat). Ce n'est qu'en vous exerçant dans les 2 écoles (Jujitsu + Taekwendo) que vous pourrez apprendre à ouvrir les portes de chakra qui sont des techniques de rang S.

Aussi votre niveau de maitrise du Taijutsu global dépendra du nombre de domaines que vous avez choisis de sacrifier au combat rapproché. Tout le monde maitrise des mouvements de base simplistes au sortir de l'académie, c'est le rang E. Pour départager 2 membres au corps à corps, il faudra regarder le niveau, mais surtout celui qui maitrise le plus de domaines dans le Taijutsu.